﻿<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<ArticleSet>
  <ARTICLE>
    <Journal>
      <PublisherName>مرکز منطقه ای اطلاع رسانی علوم و فناوری</PublisherName>
      <JournalTitle>فصلنامه مهندسی برق و مهندسی کامپيوتر ايران</JournalTitle>
      <ISSN>16823745</ISSN>
      <Volume>24</Volume>
      <Issue>1</Issue>
      <PubDate PubStatus="epublish">
        <Year>2026</Year>
        <Month>8</Month>
        <Day>5</Day>
      </PubDate>
    </Journal>
    <ArticleTitle>Design and Simulation of a DNA Tile Self-Assembly-Based Molecular Processor for microRNA Detection</ArticleTitle>
    <VernacularTitle>طراحی و شبیه‌سازی پردازنده‌ی مولکولی با کاشی‌های خودسامانی مبتنی بر دی‌ان‌ای جهت تشخیص ریزرِناها‌</VernacularTitle>
    <FirstPage></FirstPage>
    <LastPage></LastPage>
    <ELocationID EIdType="doi" />
    <Language>fa</Language>
    <AuthorList>
      <Author>
        <FirstName> زهره</FirstName>
        <LastName>بیکی</LastName>
        <Affiliation></Affiliation>
      </Author>
    </AuthorList>
    <History PubStatus="received">
      <Year>2025</Year>
      <Month>9</Month>
      <Day>27</Day>
    </History>
    <Abstract>&lt;p style="direction: ltr;"&gt;Nowdays, the design of molecular processors for disease diagnosis, particularly early cancer detection, has become one of the most active research and technology areas. In this paper, DNA-based molecular processors are introduced. First, controllable and scalable self-assembly tiles were designed. These tiles, implemented using hairpin DNA strands, are capable of receiving single-stranded inputs, generating outputs that can be utilized in subsequent steps, and enabling cascading connections across different levels. In the next step, basic logic gates (AND, OR, NOT) were constructed using the designed tiles, and a processor for detecting 12 microRNAs, aimed at early cancer diagnosis, was implemented. Simulations were performed using the VisualDSD tool under a deterministic model. The simulation results for the considered test set achieved PPV &amp;asymp; 0.91 and NPV &amp;asymp; 0.99, demonstrating the promising performance of the designed processor.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&amp;nbsp;&lt;/p&gt;</Abstract>
    <OtherAbstract Language="FA">&lt;p&gt;امروزه طراحی پردازشگرهای مولکولی جهت تشخیص بیماری&amp;zwnj;ها از جمله تشخیص زودهنگام سرطان به یکی از حوزه&amp;zwnj;ی داغ تحقیقاتی و فناوری تبدیل شده است. در این مقاله پردازنده&amp;zwnj;های مولکولی مبتنی بر دنا معرفی شده است. ابتدا کاشی&amp;zwnj;های خودسامانی کنترل پذیر و قابل گسترش طراحی شده. در این کاشی&amp;zwnj;ها که با استفاده از رشته&amp;zwnj;های سنجاق&amp;zwnj;سر پیاده&amp;zwnj;سازی شده است امکان دریافت تک رشته&amp;zwnj;های ورودی و تولید خروجی قابل استفاده در مراحل بعد و اتصال آبشاری بین سطوح مختلف فراهم شده است. در گام بعدی با استفاده از کاشی&amp;zwnj;های طراحی شده دروازه&amp;zwnj;های منطقی پایه (AND ,OR ,NOT) طراحی شده و&amp;nbsp; پردازشگری جهت تشخیص ۱۲ ریزرِنای با هدف تشخیص زودهنگام سرطان پیاده&amp;zwnj;سازی شد؛ شبیه&amp;zwnj;سازی&amp;zwnj;ها با ابزار VisualDSD و با مدل قطعی انجام شده&amp;zwnj;اند. نتایج شبیه&amp;zwnj;سازی برای مجموعه&amp;zwnj;ی آزمایشی مدنظر دارای 91&lt;sub&gt;/&lt;/sub&gt;0 &amp;asymp;PPV و&amp;nbsp;99&lt;sub&gt;/&lt;/sub&gt;0&amp;asymp;NPV است که نشان از عملکرد مناسب پردازشگر طراحی شده دارد.&lt;/p&gt;</OtherAbstract>
    <ObjectList>
      <Object Type="Keyword">
        <Param Name="Value">پردازنده‌های مولکولی، تشخیص زودهنگام بیماری، خودسامانی رشته‌های دِنا،  محاسبات مبتنی بر دِنا</Param>
      </Object>
    </ObjectList>
    <ArchiveCopySource DocType="Pdf">http://ijece.org/ar/Article/Download/51618</ArchiveCopySource>
  </ARTICLE>
</ArticleSet>